短程分子蒸馏是一种特殊的液-液分离技术，它不同于传统蒸馏依靠沸点差分离的原理。这是一种在高真空度下利用不同物质分子运动自由程的差别，对热敏性物质或者是高沸点物质进行蒸馏和纯化的过程。主要应用在化学、医药、石化、香料、塑料以及油料等工业领域。
短程分子蒸馏仪在真空度控制方面，早期的控制方式采用开环控制，此法存在较大波动现象，随着分离物纯度要求不断提高，因为这种真空控制方法稳定性差，难以满足较高纯度的要求，为解决这一问题，使真空度稳定于某一预设值时，利用气体流量控制器对反馈进行控制，以调整进气量和进气量来维持稳定的真空度。采用闭环控制实现分子蒸馏真空度的控制，液环真空泵和旋片式真空泵都要使真空度处于负压下，通过串接气体流量控制器，充分利用气体流量控制器实现分子蒸馏器真空度的稳定效果。
蒸馏过程是：物料从蒸发器的顶部加入，经转子上的料液分布器将其连续均匀地分布在加热面上，随即刮膜器将料液刮成一层薄、呈湍流状的液膜，并以螺旋状向下推进。在此过程中，从加热面上逸出的轻分子，经过短的路线和几乎未经碰撞通过抽气就到冷凝器上冷凝成液，并沿冷凝器管流下，通过位于蒸发器底部的出料管排出；残液即重分子在加热区下的圆形通道中收集，再通过侧面的出料管中流出。
分子蒸馏仪应用领域：
精细化工，如芳香油提纯.高聚物中间体的纯化.羊毛脂的提取等等
医药领域：如提取天然维生素AE等.制取氨基酸及葡萄糖的衍生物等等
食品行业：如精制鱼油.油脂脱酸.精制高碳醇.混合油脂的分离等等
其他领域：石油行业，日用化学，环保领域等等。
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